Нерестовые аквариумы по размеру обычно меньше, чем декоративные. Они должны быть прямоугольной формы, что позволяет легче замечать погибшую икру и удалять её.
Для определённых видов рыб (например, для неонов и расбор, для которых требуется исключительно чистая дезинфицирующая среда) в качестве нерестовых можно использовать только цельностеклянные аквариумы или аквариумы органического стекла, так как только они поддаются тщательной дезинфекции.
Величина карантинных, отсадочных и селекционных аквариумов может быть любой. Она определяется количеством, размерами рыб и продолжительностью их содержания.